Родился в семье астронома Оскара Андреевича Баклунда.
В 1902 году окончил Петербургский университет, с 1908 года, получив до этого степень доктора философии в Вене, работал хранителем Геологического музея Петербургской Академии наук, с 1918 года был профессором геологии и минералогии в Или (Финляндия).
В 1924—1943 годах — профессор Уппсальского университета (Швеция).
В 1947 году избран членом Шведской Королевской академии наук.Основные научные работы Баклунда написаны в области петрографии и тектоники скандинавских стран и приполярных регионов. Пересмотрел стратиграфию архейских пород Балтийского щита и установил единый цикл готокарелид.
В 1899—1901 годах был геологом русско-шведской экспедиции на Шпицбергене, в августе 1900 года совершил первое восхождение на Пик Ньютона, высшую точку архипелага Шпицберген.
В 1904 году был геологом в русской экспедиции в северную часть Сибири, в 1909 году — в северный Урал, в 1911 году — в Туркестан. Исследовал геологическое строение Алтая в 1915 году, Полярного Урала в 1916, северной Монголии в 1917.
В 1911—1913 годах, будучи государственным геологом Аргентины, исследовал месторождения олова в Аргентине и Боливии.Примечания Немецкая национальная библиотека, Берлинская государственная библиотека, Баварская государственная библиотека и др. Record #116029641 // Общий нормативный контроль (GND) — 2012—2016.
Баклунд Хельге Гётрик // Большая советская энциклопедия: [в 30 т.] / под ред. А. М. Прохоров — 3-е изд. — М.: Советская энциклопедия, 1969.
Newtontoppen. Норвежский Полярный Институт. Проверено 18 декабря 2013.