Самуил Яковлевич Айзикович родился 25 мая (6 июня) 1882 года в Вильне, в семье Янкеля Шмуэлевича и Хаи Шаевны (Гиршевны) Айзиковичей, уроженцев Лиды.
В 1910 году окончил Институт гражданских инженеров в Петербурге.
С 1912 года жил и работал в Москве. Участвовал в ряде конкурсов.Конкурсный проект «коммунального дома» (1925, архитекторы С. Я. Айзикович и Г. Я. Вольфензон) для кооперативного товарищества «1-е Замоскворечье» положил начало посёлку Шаболовка. Проект дома-коммуны для 750—800 человек Г. Вольфензона, Е. Волкова и С. Айзиковича (впоследствии осуществлён в натуре на Хавско-Шаболовском проезде в Москве) в 1926 году получил первую премию на конкурсе Моссовета.
В построенной по проекту С. Я. Айзиковича усадьбе (1915—1917) в 1930-х—1953 годах располагалась дача Л. П. Берии.Жена (1910) — Сара Максимовна Тобоцкая (из Кернова), сын Павел (1911).