Родился 6 марта 1910 года в Базеле (Швейцария) в семье политического эмигранта, сибирского казака. После Февральской революции семья вернулась в Россию.
В 1928 г. Рудольф Вяткин недолго проработал техником на новосибирском заводе «Сибсельмаш» . Затем несколько лет прослужил рядовым красноармейцем в Особой Дальневосточной армии, под командованием В. К. Блюхера. После окончания в 1939 г. китайского отделения Восточного факультета Дальневосточного государственного университета, началась преподавательская работа Р.В. Вяткина, которой он отдал 17 лет жизни, – сначала на курсах военных переводчиков Тихоокеанского флота, а с 1943 г., после перевода в Москву – в Военном институте иностранных языков, где он возглавил кафедру китайского языка, одновременно читая курс лекций по древней истории Китая в Московском институте востоковедения.
В составе группы советских китаеведов участвовал в переводе на русский язык избранных произведений Мао Цзэдуна.
В 1949 году, работая в Военном институте иностранных языков (ВИИЯ), Вяткин защитил кандидатскую диссертацию по истории на тему: «Англо-китайские отношения в период от Вашингтонской конференции до захвата Японией Маньчжурии» , в 1951 стал доцентом кафедры китайского языка ВИИЯ.
С 1956 по 1958 работал научным сотрудником Института китаеведения, позднее — старший научный сотрудник Института востоковедения АН СССР.Принимал активное участие в X (Марбург, 1957), XI (Падуя, 1958) и XVII (Лидс, 1965) международных конференциях синологов, а также XXV Международном конгрессе востоковедов в Москве в 1960 году.Внёс вклад в изучение китайского языка и методики его преподавания. Основные научные труды посвящены истории Китая, китайской революции 1925—1927, англо-китайским отношениям после 1-й мировой войны, китайской историографии.
В переводе Вяткина и с его комментариями и примечаниями были изданы «Исторические записки» («Ши цзи» ) Сыма Цяня (т. 1-6, М., 1972—1992).Автор более 120 работ и научных статей, а также учебных пособий по китайскому языку. Неоднократно награждался орденами и медалями СССР.Скончался 10 октября 1995 года, похоронен в Москве на Хованском кладбище (Центральная территория).Сын: Анатолий Рудольфович Вяткин (1946—2015) — историк, социолог.Внук: Максим Михайлович Мейер (род. 1967) — политик, социолог.