Бернардину Антониу Гомиш родился 29 октября 1768 года в Паредиш-ди-Кора. Учился на медицинском отделении Коимбрского университета, в 1793 году окончил его.
С 1797 года Гомиш работал в Королевском флоте врачом, в том же году был отправлен в Бразилию.
До 1801 года путешествовал по Бразилии, изучая лекарственные растения тропической флоры, затем вернулся в Португалию, где работал в различных военных госпиталях.
В 1810 году оставил карьеру военного врача.
В 1812 году Бернардину Антониу Гомиш впервые в Португалии привил вакцину от оспы.
В 1817 году он был назначен Королевским доктором.
На короткое время он вернулся в Рио-де-Жанейро, где был врачом австрийской принцессы Леопольдины, невесты будущего бразильского императора Педру I.13 января 1823 года Гомиш скончался. Сын Бернардину Антониу, его полный тёзка, также стал известным врачом и ботаником.