Борден Боун родился недалеко от Леонардвилла, Нью-Джерси в 1847 г. Отец — Джозеф Боун (англ. Joseph Bowne) был фермером, проповедником-методистом и аболиционистом. Мать происходила из квакерской семьи и тоже была аболиционисткой. Борден был одним из шести детей.
В детстве родители были для детей образцом высокой морали и защищали достоинство всех людей.
В 1867-1871 учился в Нью-Йоркском университете, по окончании получил степень бакалавра. Одновременно получил сертификат и начал вести службы в методисткой церкви с 1867.
В 1872 был произведён в диаконы и получил назначение в приход на Лонг-Айленде.
В 1873-1874 продолжил учёбу в университетах Европы: в Париже, Галле и Гёттингене. Наибольшее влияние на мировоззрение Боуна оказала философия Р. Г. Лотце.
В 1874-1876 Борден Боун работал журналистом в Нью-Йорке.
В 1876 защитил магистерскую диссертацию в Нью-Йоркском университете.
С 1876 и до конца жизни работал профессором в Бостонском университете. Боун был деканом факультета философии.
В 1888 стал первым руководителем аспирантуры университета.
Он предсетательствовал на защите диссертации первого в США чернокожего доктора философии Джона Боуена (англ. John Wesley Edward Bowen) в 1891.Борден Паркер Боун умер в Бостоне в 1910 г.