Лоран Боннар начал свою профессиональную карьеру в клубе «Тур» , но после перешёл в «Ле-Ман» , в 1998 году. Постепенно он стал одним из основных игроков команды, а позже и капитаном с 2004 по 2007 год. После девяти сезонов в «Ле-Мане» он перешёл за 500 тыс. евро в «Олимпик Марсель» .Прибыв летом 2007 года в Canebiere, он стал одним из открытий «Марселя» в сезоне 2007/08.
Он пришёл в качестве дублёра Тайе Тайво. Благодаря хорошей игре он стал играть на излюбленной позиции и прекрасно выполнял как оборонительные, так и атакующие функции.Его хорошая игра принесла ему признание в 2008 году и попадание в символическую сборную Trophees UNFP du football, также он был назван лучшим правым защитником Лиги 1 в сезоне 2007/08.
В конце сезона 2009/10, Дидье Дешам назначил Лорана Боннара капитаном в двух матчах против «Ланса» (1: 0) и «Ниццы» (4: 1). Несколько недель спустя Лоран Боннар отказался продлевать свой контракт с «Марселем» и стал свободным агентом.
Он готовился подписать контракт с «Ле-Маном» , где провёл девять сезонов с 1998 и 2007 год, но в течение лета 2010 года Боннар подписывает трёхлетний контракт с «Монако» .После вылета в Лигу 2 «Монако» предложил Боннару снизить свою зарплату на 50 %, от этого он отказался и его контракт, действующий ещё два года, был прекращён. 18 июля 2011 года он подписал контракт с «Лиллем» , рассчитанный на 4 года.