Беккер родился в 1928 году в Чикаго. Рано начал увлекаться музыкой, научился игре на фортепиано и уже в возрасте 15 лет играл в барах и ночных заведениях. Хотя изначально Беккер был намерен строить профессиональную музыкальную карьеру, он начал заниматься социальной наукой (при этом продолжая играть). Получил социологическое образование в Чикагском университете, хотя до какого-то момента считал социологию хобби и планировал связать жизнь с джазом. Магистерская работа была посвящена профессии музыканта, докторская диссертация — изучению учителей.Научным руководителем и учителем Беккера в Чикагском университете был Эверетт Хьюз, известный своими работами по социологии профессий. Также в молодости большое влияние на Беккера оказали исследования в духе городской антропологии, в частности, книга «Черный метрополис: исследование жизни негров в северном городе» Клэра Дрейка и Горация Р. Кейтона (1945). Будучи студентом в Чикаго и впоследствии, активно общался и дружил с Эрвином Гоффманом.Беккер изучал потребление марихуаны в рамках проекта Института исследования несовершеннолетних и Чикагского зонального проекта в 1951–1953 годах. Затем он провел три года в Иллинойсском университете, где работал над исследованиями профессий; после чего участвовал в проекте по изучению Медицинской школы Канзасского университета.
В 1962–1965 годах работал в Стэнфордском университете, в Институте изучения человеческих проблем. За свою карьеру Беккер занимал преподавательские должности в Чикагском университете, Северо-Западном университете, Вашингтонском университете, а также был приглашенным лектором в ряде европейских университетов.Беккер неоднократно получал награды за вклад в социологическую науку, исследования в области социальной психологии и символического интеракционизма и является обладателем нескольких почетных званий.
В 1999 году Говард Беккер вышел на пенсию.
В настоящее время живет в Сан-Франциско.