Получил начальное образование в Королевской высшей школе в Эдинбурге, затем обучался в Сент-Эндрюсском и Эдинбургском университетах.
В 1832 году получил диплом доктора медицины.
В 1834 году начал медицинскую практику в Эдинбурге. При этом проявлял интерес к ботанике и в 1840 году начал её преподавать.
В 1841 году получил должность профессора ботаники в Университете Глазго.
В 1845 году перешёл в Эдинбургский университет на кафедру ботаники. Был назначен хранителем Королевского ботанического сада Эдинбурга.Сын Джона Хаттона Бальфура, Исаак Бальфур (1853—1922), также был ботаником (в ботанической номенклатуре названия таксонов, описанных Исааком Бальфуром, дополняются сокращением «Balf.f.» ).
Карта сайта
