Я. И. Апельганец родился в 1939 году в Саратовской области.
В 1950 году семья была подвергнута репрессивному переселению в Краснотурьинск Сведловской области. Здесь Яков начал играть в хоккей с мячом и хоккей на траве. Его тренером был Эдуард Айрих.
К 17 годам Яков играл в основном составе «Труда» .1963—1965 годы Яков играет в Первоуральске в составе «Уральского трубника» .
Но когда Эдуард Айрих приглашает в состав вновь создаваемого клуба — «Динамо » (Алма-Ата) — Яков, не задумываясь, соглашается и переезжает в Казахстан.15 сезонов проводит Апельганец в «Динамо» , что является рекордом клуба. 416 игр — также рекорд клуба.
В 1971 году Я. Апельганец окончил Казахский государственный институт физической культуры.По завершении игровой карьеры Я. И. Апельганец перешёл на тренерскую работу. Начинал он в тренерском штабе «Динамо» как в хоккее на траве, так и с мячом.
С 1982 по 1992 год Я. И. Апельганец работал тренером по хоккею на траве Республиканской школы высшего спортивного мастерства по зимним видам спорта, тренировал как юношей, так и девушек.
С командой девушек выиграл первенство СССР. За этот успех в 1985 году был удостоен звания Заслуженного тренера Казахской ССР.
С 1991 по 1995 год он был тренером алма-атинского «Динамо» . Так же Апельганец играл в команде мастеров «Динамо» .Умер Яков Иванович Апельганец 15 июня 2009 года в Алма-Ате.