С 1864 года изучал зоологию в университете Лилля, в 1878 году защитил там же диссертацию, посвящённую ресничным червям (фр. Contribution a l"histoire naturelle des Turbellaries).
В дальнейшем преподавал там же, до 1906 года профессор зоологии, до 1919 года профессор сравнительной анатомии и эмбриологии.Кроме того, Алле устроил в Портеле (близ Булонь-сюр-Мер) морскую зоологическую лабораторию, при которой имелись химические, фотографические и другие кабинеты, а также жилые помещения для работающих на станции.Следующие виды животных названы в честь учёного: Timea hallezi (Topsent, 1891), Procerastea halleziana (Malaquin, 1893), Scaptognathus hallezi (Trouessart, 1894), Obrimoposthia hallezi (Bohmig, 1908).