Родился 15 сентября 1953 года в Хельсинки в русско-шведской семье (отец эмигрировал из Санкт-Петербурга, мать — из семьи финских шведов).
В этой связи Алафузофф считает родными финский, русский и шведский языки. Также владеет английским и польским.
В 1950-е годы был крещён в православной церкви и обучался в финско-русской школе в Хельсинки, по окончании которой сдал экзамены для поступления в университет. Предполагая продолжить образование в гуманитарной области, поступил в Хельсинкский университет на факультет русского языка и литературы, а также практической философии, но военная служба, начавшаяся 2 мая 1973 года, изменила его планы: по окончании службы в местечке Утти (под Коувола), он поступил в школу офицеров в Хамина.
В 1974 году получил звание лейтенанта, а в 1977 году окончил Военно-морскую академию.
С 1977 по 1981 годы преподавал в военно-морском училище, где в 1979 году получил звание старшего лейтенанта.
В 1981—1982 годах вернулся в Военно-морскую академию.
В 1985 году получил звание капитанa.
С 1987 по 1989 годы учился в высшей школе офицерского состава.
С 1997 года учился в российской Академии генерального штаба, которую окончил с отличием.
С 2007 по апрель 2013 года возглавлял военную разведку Сил обороны Финляндии. Критически оценивает современную политическую ситуацию в России.17 декабря 2012 года назначен главой военной разведки Европейского союза.
В должность вступил в апреле 2013 года.15 апреля 2014 года, во время массовых протестов на Юго-Востоке Украине, заявил, что не верит в активное участие российских спецназовцев в происходящих на востоке Украины событиях. По его мнению, захваты административных зданий происходят, в основном, силами местных жителей, недовольных ситуацией в стране, но перерастание конфликта в гражданскую войну на Украине считает маловероятным.