Отец Видора был органистом и строителем органов, другом крупнейшего органного мастера XIX века Аристида Кавайе-Колля, по рекомендации которого Видор поступил в Брюссельскую консерваторию, где учился органу у Жака Николя Лемменса и композиции у Франсуа Жозефа Фети. По окончании курса Видор в 1869 г. был приглашён временно занять пост органиста в парижской церкви Сен-Сюльпис, взамен умершего Лефебюра-Вели, и состоял в этой должности в течение 64 лет, хотя постоянный контракт с ним так и не был заключён (в 1934 г. Видора сменил один из наиболее значительных его учеников, Марсель Дюпре).C 1890 года Видор был профессором органа, а с 1896 года композиции в Парижской консерватории. Среди учеников Видора были такие крупные фигуры французской и мировой музыки, как Луи Вьерн, Дариюс Мийо, Эдгар Варез, Альберт Швейцер, Димитрие Куклин.