Вильфрид Вестхайде изучал биологию, химию и географию в университетах Фрайбурга и Гёттингена.
В 1988 году он получил назначение в университет Оснабрюка на кафедру частной зоологии. Основные направления его исследований — морфология, систематика и эволюция беспозвоночных животных, в особенности кольчатых червей.Вильфрид Вестхайде входит в число ведущих зоологов и систематиков Германии. Вместе со своим коллегой Рейнхардом Ригером опубликовал несколько фундаментальных трудов в области биологии.