С детства научился играть на нескольких музыкальных инструментах. Позже поступил в военный оркестр в Винер-Нойштадте, затем был военным музыкантом в Шопрон. Переехав в Богемию, работал в качестве гобоиста в оркестрах сельских театров.Одно время играл под руководством дирижeра В. Талиха в оркестре Люблянского оперного театра (Словения).
В последующем, в составе многих музыкальных коллективов гастролировал по всему миру. Играл в Алжире, Южной Америке, Германии и Бельгии.После начала первой мировой войны был призван в австрийскую армию и направлен в музыкальное подразделение в Шопрон. После возникновения государства Чехословакия Индржих Вацек работал в театральных оркестрах в Пльзене и Ческе-Будеёвице.
В Ческе-Будеёвице занимался повышением своё музыкального образования. Окончив школу игры на органе, стал хормейстером, преподавал музыку в городах Пардубице, Високе-Мито и Каменице-над-Липоу.Среди его учеников — сын Милош (1928—2012), известный чешский композитор.