Старший брат — Андрей являлся советским и украинским ботаником и физиологом.
В 1947 году окончил Белоцерковскую среднюю школу и поступил в агрономический факультет Белоцерковского сельскохозяйственного института, который он окончил в 1952 году.
С 1952 года и до начала 1990-х годов работал в Институте физиологии растений, с 1965 по 1974 год занимал должность профессора и заведующего отделом биофизики и радиологии.
В 1974 году был избран директором данного института.
В 1955 году окончил аспирантуру при Институте физиологии растений и защитил кандидатскую диссертацию «Влияние малых доз ионизирующих излучений на растения» , в 1964 году защитил докторскую диссертацию «Естественная радиоактивность в жизни растений» на Учёном совете Отделения биологии АН УССР.
С 1974 года — член-корреспондент АН УССР, в 1990 году присвоено звание академика АН УССР (позднее — НАН Украины). Дмитрий Гродзинский изучал радиобиологические и радиоэкологические последствия аварии на ЧАЭС в 1986 году.
С 1991 по 2009 год возглавлял Национальную комиссию по радиационной защите населения Украины Верховной рады Украины.
С 2009 года на пенсии.
В последнее время проживал в Киеве. Скончался 10 августа 2016 года. Основные научные работы посвящены лучевой патологии клеточных и тканевых регуляторных механизмов. Автор более 650 научных работ, 20 монографий и учебников.Вскрыл значение репарационных процессов и эффектов в радиоустойчивости растений.Сформулировал основы теории надёжности растительного организма.Примечания Із глибоким сумом сповіщаємо, що 10 серпня ц.р. на 88-му році пішов із життя видатний учений – фізіолог рослин, радіобіолог і генетик академік НАН України Дмитро Михайлович Гродзинський (укр.). Національна академія наук України (11.08.2016). Проверено 13 августа 2016. Архивировано 13 августа 2016 года.