Этот раздел не завершён.Вы поможете проекту, исправив и дополнив его.Отец Горфункеля занимался литературным творчеством и первые свои опыты посылал В. Г. Короленко, от которого получил положительный отзыв (в письме, которое впоследствии отдал наследникам писателя).Во время Великой Отечественной войны Александр вместе с матерью и сестрой был эвакуирован в Удмуртию, в город Глазов, где они жили несколько лет.
В период с1943 по 1945 гг Горфункель А. Х. был в эвакуации в городе Переславле-Залесском Ярославской области, где окончил среднюю школу им. Ленина. Учившийся с ним за одной партой его друг Шепелёв Витя (Шепелёв Виктор Михайлович, кандидат медицинских наук, преподаватель биохимии медицинского вуза, в 2016г пенсионер, г. Дзержинский Московской области) приводит текст посвящённого ему А. Горфункелем прощального стихотворения, написанного 1 октября 1944 г. в связи с предстоящим отъездом из Переславля-Залесского в г. Ленинград: Художник очень щедрой кистьюКладёт мазки на зелень трав…Шуршат трепещущие листья,Наутро землю разубрав.Последний раз взглянуть в озёрныйЗакат. Сверкнувший. Воздух чист.И тонет в вышине просторнойВзлетевший с ветром жёлтый лист.Грустят задумчивые ивыИ снова ветровой порыв.И слышу я его призывы,И вижу — город и залив.Прощай! Мой путь в полях сквозь осень,Сквозь пыль дорог и мостовыхМой путь — от приозёрных сосенК асфальту улиц городских.Прощай! Забуду я, быть может,Закат и этот хмурый день.Пройдут года и уничтожатПоследний день, сотрут и тень.
Но день запомню молчаливый,(Он тишиной, теплом дышал).Стихи и тихий шёпот ивы,Спокойный пруд и древний вал.Отъезд Горфункеля А. Х. из эвакуации состоялся летом после госэкзаменов и получения впервые введённого тогда аттестата зрелости.
В 1950 году окончил Ленинградский государственный университет.
В 1950—1962 годах работал в архивах в Ленинграде.
В 1956 году в Институте истории АН СССР защитил диссертацию на соискание учёной степени кандидата исторических наук по теме «Вотчинное хозяйство и крестьяне Кирилло-Белозерского монастыря в XVII в.» В 1962—1984 годах заведовал Отделом редких книг и рукописей Научной библиотеки Ленинградского университета.
В 1973 году в МГУ имени М. В. Ломоносова защитил диссертацию на соискание учёной степени доктора философских наук по теме «Натурфилософия Итальянского Возрождения» .
С 1984 года — старший научный сотрудник Государственной публичной библиотеки (ГПБ), а с 1988 года — заведующий сектором редких книг и книговедения ГПБ (с 1992 — Российская национальная библиотека).
В 1993 году А. Х. Горфункель переехал вместе с женой из Санкт-Петербурга в США (штат Массачусетс), где был принят в центр Российской истории при Гарвардском университете.
В Гарварде он стал заниматься изучением жизни и творчества русского философа и поэта XVII века Яна (Андрея) Белобоцкого.