Родилась 10 ноября 1935 года в деревне Ломакино Трубчевского района (ныне — Брянской области) в крестьянской семье. Русская.
С пяти лет воспитывалась без матери.
В годы войны оставалась на оккупированной территории.
В 1955 году окончила среднюю школу в селе Плюсково.
В 1956 году вышла замуж и уехала в город Оренбург.
В том же году устроилась работать в Оренбургский резерв проводников проводником пассажирского транспорта.
С этой организацией был связана все её трудовая деятельность. Неоднократно награждалась почетными грамотами, дипломами и ценными подарками. Работала в молодежной бригаде — была наставником. Присвоено звание проводника I класса.Указами Президиума Верховного Совета СССР в 1975 и 1981 годах Гончарова Екатерина Ивановна награждена орденами Трудовой Славы 3-й и 2-й степеней.Указом Президиума Верховного Совета СССР от 3 июля 1986 года за успехи, достигнутые в выполнении заданий одиннадцатой пятилетки и социалистических обязательств, Гончарова Екатерина Ивановна награждена орденом Трудовой Славы 1-й степени. Стала полным кавалером ордена Трудовой Славы.Более тридцати пяти лет проработала в вагонном депо Оренбурга проводником.
В 1990 год ушла на заслуженный отдых, но ещё до 1996 года продолжала работать.Жила в городе Оренбург. Умерла 11 декабря 2010 года.