Родился в Бостоне, в семье Эриха Голдхагена и Нормы Бахрах; вырос в Ньютоне. Его отец, Эрих Голдхаген (Erich Goldhagen, род. 1930, Рожнов), историк и профессор Гарвардского университета, был во время Второй мировой войны с родителями заключён в Черновицкое гетто, где погибло большинство его родственников.После окончания Гарвардского университета защитил диссертацию там же (1993) и оставался доцентом отделения политологии и общественных наук до 2003 года, после чего полностью посвятил себя публицистике. Первые публицистические работы относятся к 1989 году (The New Republic). Монографии Д. Голдхагена были переведены на ряд языков и стали предметом как научных, так и общественных дискуссий.Жена — Сара Уилльямс Голдхаген (англ. Sarah Williams Goldhagen), историк архитектуры, искусствовед, автор монографии «Louis Kahn"s Situated Modernism» (Yale University Press, 2001).