Владимир Гирка родился 8 сентября 1957 года в городе Харьков. Его родители, Галина Алексеевна Гирка (Нечугуенко) (1933—1986) и Александр Алексеевич Гирка (1932—1978) родились в селе Губаревка Богодуховского района Харьковской области. Они жили в Пятихатках, на границе Харькова, и работали в расположенном там Харьковском физико-техническом институте. Через 5 лет после Владимира родился его брат Игорь, который тоже стал известным физиком.
В 1974 году Владимир окончил среднюю школу № 62 города Харькова.
В 1980 году он окончил физико-технический факультет Харьковского университета по специальности «экспериментальная ядерная физика» . Закончил заочную аспирантуру и в 1984 году защитил диссертацию кандидата физико-математических наук по специальности «Физика и химия плазмы» . Работал в научно-исследовательской части университета в должности младшего научного сотрудника, а затем — научного сотрудника. Первые научные статьи его младшего брата Игоря были написаны в соавторстве с Владимиром и, в некоторой степени, под его научным руководством. Научное сотрудничество двух братьев продолжалась всю жизнь Владимира.
В 1989 году Владимир Гирка начал преподавать на кафедре общей и прикладной физики (сейчас кафедра прикладной физики и физики плазмы) физико-технического факультета. Также преподавал на физико-энергетическом факультете, факультете компьютерных наук и на подготовительном отделении университета.
В 1998 году Владимир Гирка получил ученое звание «старший научный сотрудник» .
В 2003 году он защитил диссертацию «Поверхностные азимутальные и циклотронные волны в магнитоактивных плазменных структурах» и получил степень доктора физико-математических наук.
В 2006 году ему присвоено ученое звание профессора.