Родилась 17 марта 1924 года в Каунасе в еврейской семье. Отец — Иосиф Гин, учился во Франции, занимался предпринимательством. Мать — Ребекка. Была также сестра Алиса, учившаяся в Бельгии. Сара окончила гимназию Каунаса, соблюдала еврейские традиции и увлекалась чтением и театром.Начало Великой Отечественной войны застало Сару в родном Каунасе.
В августе 1941 года после оккупации немцами Литвы всех каунасских евреев выслали в гетто в Вилиямполе, и Сара ушла в партизаны.
В партизанском отряде «Смерть оккупантам» она встретила Михаила Рубинсонаса, который вскоре стал её мужем.
В 1943 году партизаны ушли из гетто в Руднинкскую пущу и продолжили войну против гитлеровцев. Летом 1944 года Сара со своим отрядом и частями РККА участвовала в освобождении Вильнюса: 11 августа 1944 года майором РККА была сделана её фотография, обошедшая весь мир.За годы Великой Отечественной войны Сара потеряла много родственников. Так, трое дядей Сары были убиты дворником, который ранее работал в доме дедушки и бабушки Сары и потом сбежал к полицаям (бабушка умерла от шока). Сестра Алиса со своим мужем и матерью Ребеккой погибли в концлагере Штутгоф.
В Каунасском гетто погибла вся семья Михаила Рубинсонаса.После войны Сара в 1949 году окончила экономический факультет Вильнюсского государственного университета (её муж работал журналистом). Однако в разгар «борьбы с космополитизмом» Сара была уволена с поста лаборантки. Её выручила однокурсница, посоветовавшая Саре поработать преподавателем-почасовиком. Сара была принята на кафедру общественных наук Государственной консерватории Литовской ССР, где преподавала политэкономию. Защитила в 1968 году кандидатскую диссертацию и стала кандидатом экономических наук, а через 4 года уже стала доктором экономических наук и профессором. Преподавала в Вильнюсском государственном университете, читая лекции по экономике и анализируя проблемы производства и потребления в Литве. Сара Иосифовна подготовила 11 аспирантов, которые защитили свои диссертации.
В 1983 году с разрешения советских властей Сара с семьёй уехала в Канаду, где стала преподавать в Йоркском и Торонтском университетах, а также писать статьи. По инициативе С.Гинайте университеты Торонто и Вильнюса начали реализацию программы по обмену студентами.
С тех же пор Сара Гинайте стала участвовать активно и в жизни литовской общины Канады.
В конце 1980-х — начале 1990-х Гинайте занялась изучением истории литовских евреев, в особенности Холокоста в Литве и антинацистского сопротивления.
В 1994 году она написала статью «Начало трагедии еврейского народа в Литве» , в 1999 году в Вильнюсе ею была выпущена «Книга памяти» , а в 2005 году в Торонто вышла книга «Сопротивление и выживание. Еврейская община Каунаса в 1941-1944» , которую признали лучшей книгой года в Канаде.
В 2008 году Сара Гинайте выступила в защиту советских еврейских партизан, обвиняемых в массовом убийстве поляков в деревне Канюкай, и обвинила литовскую прокуратуру в попытке очернить литовских евреев, воевавших с оружием в руках против нацистов.
В 2012 году Сара Гинайте выпустила альбом «Pro Memoria» , где собраны фотографии всех её родственников и членов её семьи, начиная с 1912 года.Владеет литовским, русским, английским, немецким и идишем.