Родилась 6 марта 1886 года в городе Монтесано (штат Вашингтон).
В 1903 году семья переехала в Корваллис (Орегон), Хелен поступила в Орегонский сельскохозяйственный колледж (ныне — Университет штата Орегон).
В 1911 году получила степень магистра.
В 1912 году начала подготовку диссертацию доктора философии в Калифорнийском университете в Беркли. Защитив диссертацию в 1915 году, в течение нескольких лет Гилки работала иллюстратором в Беркли.
С 1918 года — куратор гербария Орегонского сельскохозяйственного колледжа, впоследствии в звании профессора.
В 1951 году ушла на пенсию.
В 1959 году, после смерти сменившего её в должности куратора Альберта Стюарда, некоторое время вновь исполняла обязанности куратора гербария.Автор ряда работ по трюфелям и близким грибам, а также по систематике цветковых растений. Последнюю работу опубликовала в 1967 году.