Геммерлинг изучал с 1920 по 1924 естествознание в Берлинском университете, а также кратковременно — в университете Марбурга. Его учителями в Берлине были Готлиб Хаберландт по ботанике и Макс Хартманн (нем. Max Hartmann) по зоологии.
В 1924 году ему была присуждена учёная степень доктора философии.
С 1924 по 1940 годы Геммерлинг первоначально был младшим научным сотрудником (с Максом Хартманном) в биологическом Институте кайзера Вильгельма в Берлинском районе Далем, с 1931 — приват-доцентом.
В 1940 году Геммерлинг стал директором немецко-итальянского Института биологии моря в Ровине.
С 1942 по 1945 годы он был адъюнкт-профессором морской биологии в Берлинском университете.
В 1946 году он стал заведующим отделом биологического Института кайзера Вильгельма в Лангенаргене на Боденском озере.
С 1949 по 1970 годы Геммерлинг был директором Института биологии моря[de] Общества Макса Планка (с 1968 года — клеточной биологии) в Вильгельмсхафене.Хаммерлинг работал, в частности, над изучением гигантской одноклеточной водоросли Ацетабулярия.Примечания Вариант записи фамилии на русском — Хаммерлинг.