В 1909 году окончил земскую школу и поступил в Вяземское духовное училище.
В 1916 году окончил училище и получил звание учителя.
С марта 1917 года заведовал Хватов-заводским волостным отделом народного образования в Юхновском уезде Смоленской губернии.
В октябре 1918 года вступил в ВКП(б).
В 1920 году был делегатом II Всероссийского съезда ответственных организаторов деревни, где слушал выступление В. И. Ленина.
В январе 1920 года переехал в Рославль, где заведовал культурным отделом железнодорожных мастерских, был избран членом учппрофсожа и секретарём фракции РКП(б).
В 1929 году был обвинён в том, что он якобы сын князя Гагарина из Сызранского уезда. За это был исключён из партии, но вскоре восстановлен (собрав отзывы десятков знавших его коммунистов).
В августе 1930 года зачислен в Институт красной профессуры.Похоронен на Новодевичьем кладбище. Специализировался на изучении истории и теории атеизма.Самостоятельно выучил немецкий язык для изучения философских взглядов Франца Меринга.Избранные трудыГагарин А. П. Долой богов! // Антирелигиозный, пасхальный иллюстрированный журнал. — Смоленск, 1923. — С. 1.Гагарин А. П. Рабочий класс, наша партия и тов. Ленин. — Смоленск, 1924. — 15 с.Гагарин А. П. Хозяйство, жизнь и настроения деревни. — М.; Л., 1925. — 112 с.Гагарин А. П. Общественная закономерность и объективная реальность. — М., 1931. — 128 с.Гагарин А. П. Франц Меринг и его философские взгляды. — М., 1937. — 140 с.Гагарин А. П. Американская буржуазная философия и социология на службе империализма. — М., 1950. — 47 с.2-е изд. — 1951. — 116 с.3-е изд. — 1953. — 207 с.Гагарин А. П. Борьба за установление Советской власти в Юхновском районе. — Смоленск, 1958. — 77 с.Гагарин А. П. Правда о христианской религии и нравственности. — М., 1961. — 48 с.