Родился в селе Хидры Гродненской губернии (ныне — Брестская область), территория которой была оккупирована войсками Центральных держав, по другим данным — в деревне Худяково Лопатинской волости Курганского уезда Тобольской губернии (ныне Лебяжьевский район Курганской области), куда в том же году переехала семья. Белорус.
В 1933 году окончил начальную школу и стал работать конюхом в колхозе «Четвёртый завершающий» в деревне Худяково.
В 1935 году окончил школу механизации и электрификации сельского хозяйства в селе Петухово. Работал механиком, трактористом, комбайнером в Лопатинской МТС.
В жатву 1936 года убрал около двухсот гектаров хлебов и сразу же зарекомендовал себя мастером на хлебной ниве.
В военные годы Дубенко ежегодно убирал урожай с площади 1000—1200 гектаров.16 августа 1937 года его отец Фёдор Яковлевич Дубенко был арестован. 23 сентября 1937 года приговорен Тройкой УНКВД по Челябинской области по обвинению в антисоветской агитации, ст.58-10 УК РСФСР к 10 годам лишения свободы. Реабилитирован 15 июня 1963 года Курганским облсудом.
С 1946 года член ВКП(б).Продолжал ударно трудится и в послевоенные годы. Прекрасное знание сельскохозяйственной техники, навык обращения с нею позволяли Дубенко не раз выступать в роли зачинателя различных починов. Перейдя с «Коммунара» на «Сталинец-1» , он освоил работу на сцепе из двух комбайнов. Квалифицированных комбайнеров в те годы было ещё мало, и пример Дубенко оказался более чем кстати.
В 1950 году работая на комбайне «Сталинец-6» за 35 рабочих дней с убранной им площади намолотил 8238 центнеров зерна. Всего за жатву 1950 года, вместе со своей помощницей Анной Михайловной Беловой он выдал рекордный по тем временам намолот более 9 тысяч центнеров.Указом Президиума Верховного Совета СССР от 14 мая 1951 года за достижение в 1950 году высоких показателей на уборке и обмолоте хлебов Дубенко Василию Фёдоровичу присвоено звание Героя Социалистического Труда с вручением ордена Ленина и Золотой медали «Серп и Молот» .
В 1951 году он удвоил свой предыдущий показатель и в 1952 году ему вручён второй орден Ленина.
В 1958—1960 годах работал заместителем председателя колхоза имени Ленина.
В 1961—1977 годах — управляющим Худяковского отделения совхоза «Колос» .Неоднократно избирался депутатом областного Совета народных депутатов, был членом Лебяжьевского райкома партии, членом парткома совхоза «Колос» . Был делегатом II Всесоюзного съезда профсоюза земельных органов (1951 год). Принимал участие в работе Всесоюзного съезда профсоюзов работников сельского хозяйства (1954 год) и во Всесоюзной конференции сторонников мира (1952 год).Жил в деревне Худяково Лопатинского сельсовета Лебяжьевского района Курганской области.Василий Фёдорович Дубенко ушёл из жизни 20 сентября 1979 года.
Карта сайта
