Родился пятым сыном в семье торговца. Провёл детство и юность во Франкфурте-на-Майне. Окончил философский факультет Тюбингенского университета.
В 1870 году вместе со своими старшими братьями Альбертом (1845—1899) и Фридрихом (1849—1914) переехал в Вену и после смерти своего брата Эмиля (1842—1882) участвовал в семейном бизнесе. Альберт и Эмиль основали сталелитейное производство.Обладал с детства художественным талантом, поэтому стал учеником живописца Венцеля Оттокара Нольча (1835—1908). Вскоре, однако, Отто Бёлер обратился к искусству силуэта и вскоре стал известным шаржистом.Будучи музыкальным поклонником, знакомым со многими немецкими и австрийскими композиторами, дирижёрами и музыкантами, нашёл в музыкальной среде богатое поле для своего творчества. Среди друзей Бёлера были оперные певцы и певицы Амалия Матерна, Герман Винкельман, Теодор Рейхман и музыканты Венского филармонического оркестра. Был поклонником Рихарда Вагнера.
В 1876 году, как меценат участвовал в организации проведения первого Байрёйтского фестиваля.Похоронен на Хитцингском кладбище Вены.