Родился в семье потомственного морского офицера Александра Григорьевича Бутакова и его супруги фрейлины Ольги Николаевны, урожденной Казнаковой.
В 1917 году в должности вахтенного начальника служил на эскадренном миноносце «Мощный» .
В 1918 году занимал должность ревизора эскадренного миноносца «Десна» .
В 1919 году занимал должность начальника распорядительной части Действующего отряда Балтийского флота.
В 1920 году, командуя канонерской лодкой «Эльпидифор» Черноморского флота, 3-м дивизионом канонерских лодок Азовской флотилии и с 31 июня - дивизионом истребителей, участвовал в боевых действиях против белогвардейских частей, в одном из боев был ранен в правую ногу. Награждён орденом Красного Знамени «…за отличия, проявленные при постановке минных заграждений в Керченском проливе и в бою 14 августа 1920 года, в коем отряд истребителей, отрезанный от своей базы превосходящими силами противника, прорвался к базе, нанеся судам противника значительные повреждения» .14 января 1921 года Бутаков был назначен командиром дивизиона истребителей и сторожевых кораблей Морских сил Чёрного моря.
В июне-июле 1925 года командовал дивизионом сторожевых и торпедных катеров.
В 1925—1926 годах командовал эскадренным миноносцем «Шаумян» .
В 1926 году камандовал дивизионом бригады сторожевых и торпедных катеров Морских сил Чёрного моря.
В мае 1926 года арестован ОГПУ по делу монархической группы «Боевое ядро» , уволен из рядов РККА и выслан в ссылку на Урал.13 марта 1933 года восстановлен в РККФ и 23 марта назначен исполняющим должность командира 3-го дивизиона бригады торпедных катеров Краснознаменного Балтийского флота. 26 декабря того же года утвержден в должности командира дивизиона. 21 марта 1936 года присвоено звание капитана 2-го ранга. 15 июля 1937 года назначен исполняющим должность командира эскадренного миноносца «Сторожевой» .
В апреле 1938 года назначен командиром 1-го дивизиона бригады миноносцев. 2 июня 1938 года арестован и 15 июня того же года уволен из рядов РККФ.Постановлением военного трибунала КБФ от 15 февраля 1940 года уголовное дело в отношении Бутакова прекращено и 18 февраля он был освобожден. 26 апреля 1940 года приказ об увольнении в отношении Бутакова был отменен, он был восстановлен в звании и уволен в запас. 22 августа 1940 года приказ об увольнении в запас был отменен и Бутаков был назначен уполномоченным постоянной Приёмочной комиссии ВМФ. 13 мая 1941 года назначен старшим уполномоченным постоянной Приёмочной комиссии ВМФ.