Герта Боте родилась 8 января 1921 года в Тетерове, Свободное государство Мекленбург-Шверин, Германия. Боте помогала своему отцу, который имел магазин древесины, некоторое время служила на фабрике.
В 1939 году вступила в Союз немецких девушек, где имела высокие результаты по лёгкой атлетике.
В 1940 году устроилась на работу в немецкий госпиталь в качестве медицинской сестры.
В 1942 году получила приглашение на работу надзирательницей в концентрационный лагерь Равенсбрюк. После четырёхнедельного предварительного обучения Боте была отправлена в Штуттгоф, концлагерь, находившийся поблизости от города Гданьска.
В нём Боте получила прозвище «Штуттгофская садистка» из-за жестокого обращения с женщинами-заключёнными.
В июле 1944 года была послана Гердой Штайнхофф в концлагерь Бромберг-Ост.
С 21 января 1945 года Боте была надзирательницей во время марша смерти заключённых, проходившего от центральной Польши до лагеря Берген-Бельзен. Марш закончился 20-26 февраля 1945 года.
В Берген-Бельзене Боте руководила отрядом женщин, состоявшим из 60 человек и занимавшимся производством древесины.После освобождения лагеря была арестована.
На Бельзенском Процессе была приговорена к 10 годам заключения. Отпущена ранее указанного срока 22 декабря 1951 года.
В 2004 году в документальном сериале Holokaust было показано её интервью.