Во время Первой мировой войны семья эвакуировалась в Россию и осенью 1915 года обосновалась в Москве. Здесь Казис Борута начал учиться в гимназии.
В 1918 года вернулся с родителями в Литву.Учился в Мариямполе в гимназии, с 1920 года в учительской семинарии, откуда был исключён за празднование 1 Мая; экзамены об окончании сдал экстерном. Поступил в 1924 году в каунасский Литовский университет, в 1925 включился в деятельность эсеров-максималистов и был исключён из университета за противоправительственные выступления (протест против смертных казней).
В 1926, 1928—1930 годах учился в Венском и Берлинском университетах.
В 1927 году был выслан из Литвы за антигосударственную деятельность. Живя в Риге (1927—1928), сотрудничал с латышскими писателями и художниками левых взглядов, организовал издательство, выпустил литературный альманах «Аудра» («Буря» ), сборник стихов «Литва крестов» , сборник рассказов «Ветер смуты с полей» .
В 1928 году был выслан из Латвии.Был одним из учредителей и активных сотрудников авангардистского левого журнала «Трячас фронтас» («Третий фронт» ; 1930—1931) — органа третьефронтовцев.
В 1931 году вернулся в Литву.
В 1932 году был редактором альманаха «Дарбас» («Труд» ). За участие в подрывной нелегальной деятельности отбывал заключение в 1933—1935.
В 1935—1940 годах занимался литературной, редакторской, журналисткой работой, работал в редакции журнала «Деновидис» .
С 1940 года жил в Вильнюсе. После войны работал в Институте литовской литературы до 1946.Весной 1946 года был арестован советскими репрессивными органами по обвинению в принадлежности к нелегальной патриотической организации. Отбывал наказание в лагере в Воркуте.
В 1956 году вернулся в Вильнюс. Вернулся к литературной работе, занимался переводами, переложениями для детей народных сказок.
В 1965 году удостоен звания заслуженного деятеля культуры Литовской ССР.
В том же году умер. Похоронен на кладбище Расу в Вильнюсе.