Племянник императора Наполеона, старший сын Люсьена Бонапарта и его второй жены Александрины де Блешам (1778—1855). Принц Музиньяно (как его называли в молодости) посещал различные итальянские университеты и затем отправился в США, где посвятил себя изучению природы. Плодом этого было фундаментальное сочинение «Американская орнитология» (3 тома, Филадельфия, 1825), составившее ему репутацию в научном мире.28 июня 1822 года женился в Брюсселе на своей кузине, Зинаиде Шарлотте Юлии (дочери Жозефа Бонапарта).
В честь жены впоследствии назвал род горлиц-зенайд. Затем на некоторое время перебрался к тестю в Филадельфию. По возвращении из Америки он поселился в Риме, где издал труд «Иконография итальянской фауны» (Позвоночные, 3 т., Рим, 1833—41, большой фолиант). Кроме того, в различное время он написал: «Spechio comparativo delle ornithologie di Filadelfie» (Рим, 1827), «Sulla seco n da edizione del regno animale di Cuvier» (Болонья, 1830), «Catalogo metodico dei mammiferi europei» (Милан, 1845) и «Catalogo metodico dei pisci europei» (Неаполь, 1846).
Он основал периодические собрания итальянских учёных, на которых его несколько раз избирали президентом.
В Риме Бонапарт принимал деятельное участие в революционных движениях 1847—48 годов, принадлежал к партии либералов, объявивших Римскую республику, и в 1849 году поочередно занимал места вице-президента и председателя Учредительного собрания.
Он участвовал в обороне города от 40-тысячных французских войск, отправленных его двоюродным братом, Луи Бонапартом. После поражения итальянской республиканской армии и вступления французов в Рим в июле 1849 года бежал во Францию. Однако уже при высадке в Марселе правительство Луи Бонапарта запретило ему пребывание во Франции, а когда он, несмотря на это, продолжил своё путешествие в Париж, то был арестован в Орлеане и отправлен в Гавр, откуда отплыл в Англию.Только позже удалось ему выхлопотать себе право возвращения в Париж, где он и жил с середины 1850 года, занимаясь естественными науками, и в 1854 году сделался директором Парижского сада растений.
В это время, кроме «Conspectus systematum Mastozoologiae» (Лейден, 1850), он опубликовал «Conspectus generum avium» (томы 1 и 2, Лейден, 1850 г.), а также ряд монографий (напр. «Monographie des Soxiens» , 1850 г.).
В 1855 году был избран иностранным членом Шведской королевской академии наук.
Он умер 29 июля 1857 года в Париже. После его смерти вышло ещё одно большое сочинение: «Iconographie des Pigeons non figures» (Париж, 1858).Имя Шарля-Люсьена увековечено в международных наименованиях семейства пингвиновых (Spheniscidae Bonaparte) и нескольких видов птиц: горный тинаму (Nothocercus bonapartei), бонапартова чайка, золотобрюхий инка (Coeligena bonapartei), Gymnobucco bonapartei.
Карта сайта
