Уильям Вашингтон Бодайн родился 15 января 1892 года в Нью-Йорке. Его отца также звали Уильям, он работал водителем в молочной компании; мать звали Элла Моран. У Уильяма было два младших брата: Гарольд, который тоже стал режиссёром, однако гораздо менее известным; и Тед, который умер вместе с отцом в 1905 году от пневмонии.
В 1909 году Бодайн начал карьеру киноактёра, поступив на работу в киностудию American Mutoscope and Biograph Company.
С 1911 года начал работать ассистентом режиссёра, с 1913 года — сценаристом, а с 1915 года — режиссёром.
С 1915 года работал на киностудию Kalem Company.
В дальнейшем в 1916—1926 годах работал на студии Goldwyn Pictures[en], Metro Pictures, First National Pictures, Warner Bros. Во второй половине 1930-х годов работал на студии 20th Century Fox, Paramount Pictures, Universal Pictures.
В 1935—1937 годах жил в Великобритании, куда был приглашён (наряду с Раулем Уолшем и Алланом Двоном) как опытный режиссёр, и где создал несколько успешных картин.
В конце 1930-х годов Бодайна начали преследовать неприятности: не было достойных предложений от крупных киностудий; банк, в котором он хранил значительную часть своих сбережений, лопнул; большую сумму пришлось отдать правительству Великобритании в виде налогов.
В итоге, от безысходности, с 1940 года Бодайн стал режиссировать малобюджетные B-фильмы (его жалованье составляло около .mw-parser-output .ts-comment-commentedText{border-bottom: 1px dotted;cursor: help}@media(hover: none){.mw-parser-output .ts-comment-commentedText: not(.rt-commentedText){border-bottom: 0;cursor: auto}}500 долларов в неделю), хотя он и понимал, что это испортит его репутацию высококлассного и высокооплачиваемого специалиста. Действительно, на долгие годы он стал режиссёром таких малобюджетных фильмов, работая в основном на студию Monogram Pictures[en]. Примечательно, что в отдельных случаях на создание полнометражного фильма у Бодайна уходили считанные дни, рекорд — картина за пять дней. Авторы книги «Пятьдесят худших фильмов всех времён и народов» (1978), оценивая деятельность Бодайна того периода, дали режиссёру нелестное прозвище «Один-Дубль» , так как он редко, в целях экономии, делал дубли, даже если актёры забывали роль или не срабатывали спецэффекты.
С 1951 года Бодайн стал режиссёром телефильмов и телесериалов, а в середине 1950-х годов был приглашён на работу в студию Уолта Диснея, где снял несколько успешных картин.17 октября 1914 года женился на девушке по имени Маргерит Флейшер и прожил с ней пятьдесят пять с половиной лет — до самой своей смерти. Сестра его жены была матерью актёра Бобби Андерсона[en] (1933—2008).
В 1960 году был удостоен звезды на Голливудской «Аллея славы» (Вайн-стрит, 1777).
В 1968 году, в связи с проблемами со здоровьем, Уильям Бодайн отошёл от дел, последние два его фильма были выпущены через несколько лет после смерти режиссёра. Скончался Бодайн 18 марта 1970 года в Лос-Анджелесе от острой почечной недостаточности. Похоронен на кладбище «Голливуд навсегда» .Два фильма Бодайна, «Маленькая Анни Руни» (1925) и «Мама и папа[en]» (1945), удостоены места в архиве Академии кинематографических искусств и наук.