В 1934 году переехал в Братиславу и посвятил этому городу всю оставшуюся жизнь.
В 1934 году после переезда в Братиславу поступил в Словацкий университет, который окончил в 1939 году. После окончания данного университета, был направлен администрацией в институт гигиены, который входил в состав Словацкого университета, где он до 1946 года работал в качестве научного сотрудника.
С 1947 по 1950 год заведовал отделом микробиологии Государственного института здравоохранения.
В 1950 году был избран директором Словацкого института биологии. Данную должность он занимал до 1953 года.
В 1953 году был избран директором института вирусологии и проработал в этой должности до распада ЧССР, после чего вплоть до своей смерти работал научным консультантом в данном институте.Скончался Диониз Блашкович 17 ноября 1998 года в Братиславе.