Начальный период работы был связан с кратким преподаванием в средней школе.
С 1893 года, сменив Константина Иречка, он становиться профессором Венского университета по кафедре славянской филологии, где занимается, в частности, исследованиями в области исторической славистики. Научный вклад Ярослава Бидло в области общей истории с особым акцентом на историю Восточной Европы и Балканов, обеспечили ему членство в Королевском Чешском научном обществе и статус действительного члена Чешской академии наук и искусств. Также, он был членом Академии польского, югославского и русского языков. Являлся действительным членом львовского Научного общества имени Тараса Шевченко.Ярослав Бидло активно работал на ниве развития международных научных связей. Например, публиковал в чешских научных журналах рецензии на украинские издания, в том числе на книгу М. Грушевского «Історія України-Руси» , а также на работы К. Студинского, А. Крымского и др. Выступал с сообщениями о состоянии науки на страницах ежедневной газеты «Prager presse» .