Родилась в городе Маланг в Голландской Ост-Индии (современная Индонезия) 13 июля 1893 года.
В 1923 году защитила диссертацию доктора философии в лаборатории Вилли-Коммелин-Схолтен в Барне под руководством Йоханны Вестердейк.
В диссертации пересмотрела систематику сложнейших в систематическом отношении родов Monilia, Oidium, Oospora и Torula. Впервые обосновала самостоятельность рода Candida, основываясь на микроморфологических и культуральных характеристиках.Уже во время подготовки диссертации у Беркхаут обострились проблемы со здоровьем. Умерла 18 ноября 1932 года в Гааге.