Среди учеников А. В. Советова и В. В. ДокучаеваОкончил в 1890 году естественное отделение физико-математического факультета Санкт-Петербургского университета; его диссертационная работа «Культура растений бобовых» была отмечена золотой медалью.Работая в министерстве сельского хозяйства, В. Д. Батюшков собрал материал, который использовал в своей работе «Свод статистических материалов, касающихся сельского населения европейской России» (1894); книга была признана неблагонадёжной и изъята из обращения.
С 26 марта 1908 года по 15 июля 1917 года был директором Императорского сельскохозяйственного музея в Санкт-Петербурге.
В 1912—1913 годах он организовывал конкурсы сельхозмашин.По состоянию на 1915 год — камергер, статский советник.После 1917 года состоял в комиссии «Электроплуг» , в Тракторном комитете, сельскохозяйственной секции Госплана; разработал проекты по тракторизации и электрификации сельского хозяйства страны, сотрудничал при составлении плана ГОЭЛРО, предоставив ценные материалы по планированию электрификации сельского хозяйства. По его инициативе состоялся Всероссийский конкурс конструкторов электропахотных орудий.
В 1921—1922 годах В. Д. Батюшков выступил инициатором создания факультетов индустриального земледелия при высших технических учебных заведениях и первым начал читать курс по индустриализации сельского хозяйства в Петроградском политехническом институте.Примечания Придворный календарь на 1915 год.