Изучала культуроведение в Варшавском университете. Окончила также Школу общественных наук при Польской Академии Наук. Её докторат по философии одним из первых в Польше был посвящен философским аспектам феминистских теорий и дискуссий, которую вели феминистки с психоанализом и постмодернизмом.
В 1999—2008 годах Иоанна Батор работала адъюнктом в Институте философии и социологии ПАН, в 2007—2011 годах преподавала также в Польско-японской высшей школе компьютерных технологий и других вузах Варшавы. Является поклонницей японской культуры. После первого её двухлетнего пребывания в Японии как стипендиатки (JSPS, Cannon Foundation in Europe и Japan Foundation) вышла её книга «Японский веер» (2004, 2011), награждена Премией издателей и Премией имени Беаты Павляк в 2005 году.
С 2011 года Йоанна Батор посвящает время исключительно написанию книг. Первая её книга «Женщина» (2002) не принесла сенсаций, зато второй роман, «Песчаная Гора» (2009) принес успех в Польше и за рубежом, а закрепил второй — «Хмурдалия» (2010). Следующим стал роман «Темно, почти ночь» (2012).