Родился в семье врача.
В 1919 году окончил медицинский факультет Киевского университета.
В этом же году стал членом КПСС и принимал участи в гражданской войны, в организации здравоохранения на Украине.
С 1923 по 1930 годы Баткис работал на кафедрах социальной гигиены Второго и Первого МГУ.
С 1931 года заведовал кафедрой социальной гигиены и организации здравоохранения Второго ММИ им. Н. И. Пирогова.
В 1944—1950 гг. Баткис был заместителем председателя, а с 1958 года председателем Центральной санитарно-статистической комиссии М3 СССР.
С 1929—года он был членом президиума Всесоюзного гигиенического общества. Был соредактором второго издания Большой медицинской энциклопедии.