Джастин Барта родился 21 июля 1978 года в Форт-Лодердейле (штат Флорида, США) в еврейской семье Стивена Барта, агента по недвижимости, и Бетти Барта, учительницы. Когда Джастину было 8 лет, его семья переехала в Западный Блумфилд (штат Мичиган).
В возрасте 15 лет Джастин начал заниматься актёрским мастерством после того, как сломал запястье, играя в теннис.
Он сыграл роль в постановке «Сон в летнюю ночь» , после чего основал собственную детскую театральную группу, в которую входило около 15 учеников его школы.
В театре ребята ставили пьесы и выступали с ними в детских больницах и начальных школах. После этого Джастин начал брать в Детройте уроки актёрского мастерства у преподавателей из Нью-Йорка. По окончании школы в 1996 году Джастин переехал в Нью-Йорк, где в итоге окончил Нью-Йоркский университет.