Учился у своего отца, дяди, Карла Филиппа Эмануила, и другого дяди, в Англии, Иоганна Кристиана.
В Англии он провёл несколько лет, где стал известен как солист и музыкальный педагог.После смерти дяди ездил в Париж и Нидерланды, затем вернулся в Германию, где сперва занимал должность капельмейстера в Миндене (в 1786 году), а в 1789 году был вызван королём Вильгельмом Фридрихом II в Берлин, где стал клавесинистом королевы Фридерики Луизы Гессен-Дармштадтской. После её смерти — клавесинистом и придворным капельмейстером королевы Луизы фон Мекленбург — Стрелиц, супруги Фридриха Вильгельма III, и учителем музыки прусского принца.13 августа 1805 года вступил в берлинскую масонскую ложу Friedrich zu den drei Seraphim.
В 1811 году, после смерти Луизы, он ушёл со службы. Принц Генрих, брат Фридриха Вильгельма III пожаловал ему пожизненную пенсию в размере 300 рейхсталеров как внуку И. С. Баха.Был дважды женат. От первого брака имел двух дочерей, а от второго — сына, умершего в младенчестве, последнего потомка Иоганна Себастьяна Баха по мужской линии.
На открытии памятника его деду в Лейпциге, 23 апреля 1843 года он встречался с Робертом Шуманом, который позднее описывал его как «крайне живого престарелого джентльмена 84 лет со снежно-белой шевелюрой и выразительными чертами» (Neue Zeitschrift fur Musik), и Феликсом Мендельсоном — Бартольди.Умер в 1845 году, похоронен на Втором кладбище при церкви Святой Софии в берлинском районе Митте.
С его смертью род Иоганна Себастьяна Баха (прямая мужская линия) прервался.