Родился 19 марта 1818 года в Линце (ныне — в составе Шёнфельда) близ Гросенхайна. Учился в Мейсене, в 1839 году переехал в Лейпциг для обучения медицине в Лейпцигском университете, однако вскоре решил обучаться педагогической деятельности. Посещая лекции Густава Кунце, Ауэрсвальд заинтересовался изучением ботаники.Ауэрсвальд длительное время преподавал в школах в Лейпциге. Регулярно проводил экскурсии, собирая образцы грибов, растений, насекомых, моллюсков.
В последние годы страдал туберкулёзом лёгких, 1869 год проводил в Тироли. 30 июня 1870 года скончался.Ауэрсвальд принимал участие в написании разделов, посвящённых дискомицетам и пиреномицетам в Mycologia Europaea Л. Рабенхорста.