Карло Аморетти родился 13 марта 1741 года в городе Онелье (итал. Oneglia).
В 1757 году вступил в августинский орден, но вскоре оставил его и сделался мирским священником.
До 1797 года он состоял профессором церковного права в университете города Парма.Из Пармы Аморетти был вызван в Милан, где ему предоставили должность консерватора (хранителя) Амброзианской библиотеки.
С 1775 по 1777 год работал редактором научного журнала «Scelta di opuscoli interessanti tradotti da varie lingue» , который затем сменил название на «Opuscoli scelti» , а в 1804 году на «Nuovi opusculi scelti» .
В обширном сочинении «Nuova scella d"opuscoli interessanti sulle scienze e sulle arti» (27 томов, Милан, 1775—88) Аморетти стремился познакомить своих соотечественников с научными успехами других наций в областях археологии и истории искусств.Ему обязаны изданием рукописи Леонардо да Винчи (Милан, 1804 и 1816), Фумагаллисов «Codex diplomaticus Ambrosianus» (Милан, 1805), описания путешествий Феррера Мальдональдо (Милан, 1811) и Антонио Пигафетта (Милан, 1800). Кроме того, Аморетти написал «Della rabdomanzia ossia elettrometria animale» (Милан, 1808), «Elementi di elettricita animale» (Милан, 1818) и «Viaggio di Milano ai tre laghi» (Милан, 1814).Скончался 25 марта 1816 года в Милане. Его племянница Мария Пеллегрина Аморетти стала третьей женщиной, поступившей в аспирантуру, несмотря на современное ей положение женщин.