Родилась 6 апреля 1936 года в Пятигорске. Происходит из рода карачаевских узденей Алиевых. Отец — Умар Баблашевич Алиев, известный тюрколог, писатель; в 1944 году, как карачаевец, был депортирован в Киргизию. Вскоре семья вслед за главой семейства уехала во Фрунзе.
В 1959 году окончила филологический факультет Ростовского государственного университета.1960—1963 гг. — работала в газете «Кабардино-Балкарская правда» .1966—1967 гг. — старший библиограф Государственной библиотеки имени В. И. Ленина.1967—1970 гг. — старший редактор в издательстве «Книга» .1970—1972 гг. — собкор «Литературной газеты» .
В 1972 году защитила кандидатскую диссертацию по творчеству Э. Казакевича.1972—1976 гг. — старший редактор журнала «Литературное обозрение» .1976—1980 гг. — старший редактор в издательстве «Советский писатель» .
В 1986-87 годах литературно-критические статьи С. Алиевой печатаются в журналах «Октябрь» (1986, № 10), «Звезда» (1987, № 3), «Дружба народов» (1986, № 10), «Дон» (1986, № 10).
С 1989 года — сотрудник Института мировой литературы имени А. М. Горького АН СССР (ныне РАН).
В 1985—1992 годах С. У. Алиева подготовила и составила сборник «Так это было» о подлинной истории народов в тоталитарном советском государстве.
С 1989 года работает в Конфедерации репрессированных народов СССР.
С 1995 года — президент Союза женщин Северного Кавказа, член координационного совета Международной правозащитной ассамблеи (Москва).
В 2005 году, в рамках проекта «1000 женщинам — Нобелевская премия мира 2005 года» («1000 PeaceWomen» ), была выдвинута кандидатом от России на Нобелевскую премию мира.