Родился в Регенсбурге. Учился в йенском университете. По окончании университета в 1658 году ненадолго вернулся в Регенсбург, в 1660 году переехал в Нюрнберг.
В 1662 году стал членом основанной в это время нюрнбергсой академии изобразительных искусств.
С 1669 года вплоть до самой смерти был ректором академии.
В 1678 году Аймарт основал первую нюрнбергскую обсерваторию, которая первоначально располагалась в одном из бастионов нюрнбергской крепости.
В обсерватории работали почётный член петербургской академии наук Иоганн Доппельмайер, исследовательница луны Мария Клара Айммарт — дочь Г. Х. Айммарта.Как астроном Айммарт известен своими картами звёздного неба,