Отец — коллежский секретарь Флегонт Васильевич Воскресенский, происходивший из духовного звания, был женат трижды.
В первом браке родились трое детей, во втором — дочь Софья, а в третьем (жена — Глафира Андреевна), из четырёх детей первым 14 (26) марта 1859 года родился сын Флегонт, а затем ещё один сын — Сергей, также ставший архитектором.
В 1874—1882 годах учился в Московском училище живописи, ваяния и зодчества (МУЖВЗ), по окончании получил звание классного художника архитектуры. Начал самостоятельную архитектурную практику с конца 1880-х годов. Вступил в Московское архитектурное общество в 1905 году. Имел обширную частную практику в Москве.
В 1910-х годах работал архитектором Страхового общества «Россия» , выполнив для него несколько крупных проектов. После Октябрьской революции Ф. Ф. Воскресенский архитектурной практикой не занимался.Исследователь московского модерна, доктор искусствоведения М. В. Нащокина отмечает дарование и индивидуальный почерк архитектора, проявлявшийся в оформлении им фасадных поверхностей осуществлённых проектов.