Родилась в Ленинграде.
В биографических справках указывается, что она родилась 26 января 1938 года, однако в своей «Исповеди» актриса отмечает, что к началу войны она девятилетней окончила 3-й класс школы, а после войны, которую она пережила в оккупации, её матери, Леокадии Николаевне (польке), удалось заметно убавить возраст дочери.Занималась в драмкружке Дома кино под руководством М. Г. Дубровина и кружке художественного слова Ленинградского Дворца пионеров.
В 1959 году окончила Школу-студию МХАТ в Москве (курс В. К. Монюкова), с 1959 по 1961 год была актрисой театров «Современник» и Советской армии, с 1961 по 1993 годы — в Театре-студии киноактёра.
С 1957 года Маргарита Володина снималась, сыграв за свою кинокарьеру около 20 ролей. Лучшей работой актрисы стала роль комиссара в фильме «Оптимистическая трагедия» , экранизации пьесы Вс. Вишневского (1963).Тринадцать лет прожила в браке с режиссёром этого фильма Самсоном Самсоновым, снявшись во многих его картинах.
В браке родилась дочь Мария. Позднее была замужем ещё два раза: второй муж, с которым она прожила пять лет, оказался аферистом; третий, врач-педиатр, — скончался через год после свадьбы.
В 1994 году уехала к дочери во Францию, живёт в Париже.Написала книгу «Исповедь актрисы» .