Родился в Хорне, Австрия. По происхождению еврей.
Он получил начальное образование в гимназии родного города, в 1880 году поступил в Венский университет и изучал тут классическую филологию и философию, получив степень доктора философии в 1886 году. Однако ещё во время учёбы под влиянием Георга Бюлера обратился к индологии.
В 1888 году он перешёл в Оксфордский университет, где до 1892 года помогал Максу Мюллеру в подготовке второго издания «Ригведы» (4 тома, Оксфорд, 1890—1892), просматривая манускрипты и принимая решения по многим новым разночтениям этого памятника. Винтерниц оставался в Оксфорде до 1898 года, будучи задействованным в различных сферах образования. Так, он выступал как лектор в Ассоциации по распространению высшего образования среди женщин, как библиотекарь в Индийском институте (англ.)русск. в Оксфорде и часто как экзаменатор по немецкому и санскритскому языкам для университета и Индийской гражданской службы (англ. Indian Civil Service).
В 1899 году он перебрался в Прагу как приват-доцент по индологии и общей этнологии и в 1902 году был назначен на профессорскую должность по санскриту и этнологии в Университете Карла-Фердинанда (англ.)русск. в Праге и проработал там до 1934 года. Семья Винтерница сдружилась с Альбертом Эйнштейном, когда тот был в Праге около 1911 года.Одной из главных работ Винтерница считается трёхтомное исследование «Geschichte der indischen Literatur» , изданное в Лейпциге в 1905—1922 годах.
В область его научных интересов входили как ведийская литература, эпос и пураны, так и буддистские и джайнские тексты, причём и научные, и поэтические. Результатом работы в Оксфорде над манускриптами стала книга: «A Catalogue of South Indian Manuscripts Belonging to the Royal Asiatic Society of Great Britain and Ireland» , вышедшая в Лондоне в 1902 году.
В дополнение к этому Винтерниц опубликовал ряд ценных статей по санскриту и этнологии в различных научных журналах.
В 1934 году ученики Винтерница О. Штайн и В. Гамперт составили библиографию работ своего учителя, в которой содержалось 452 названия.Умер в 1937 году в Праге.