Родился 8 сентября 1868 года в селении Лиминго Российской империи.
В семье, происходившей из Голландии, росло 11 детей.Первоначально обучался в лицее города Оулу, затем — в Хельсинкском университете, где с интересом изучал финно-угорские языки.
В 23 года совершил первое путешествие в Россию, где исследовал диалекты и народную поэзию удмуртов, в том числе живущих в марийском крае.
В 1891 году в течение полугода жил у удмуртского просветителя К. Андреева в деревне Большой Карлыган (ныне Республика Марий Эл).
В 1894 году Вихманн совершил второе путешествие с посещением Карлыгана и других марийских деревень.
В 1901 году он отправился в край коми, работал в архивах Казани, где обнаружил редкие материалы о финно-угорских древностях.Затем Юрьё Вихманн посетил Венгрию. Здесь изучал венгерский язык и женился в 1905 году на венгерке Юлии (Julia Maria Wichmann), этнографе по специальности.
В 1905—1906 годах он совершил третье путешествие в марийские края Российской империи уже вместе с женой. Жил и собирал материалы в селах Яранского уезда. По возвращении в Финляндию, в Хельсинкском университете занимался систематизацией собранных материалов, в результате издав труды по фольклору и этнографии марийцев.
В 1930-е годы многие из сотрудничавших с ним марийских интеллигентов были объявлены «агентами фашистской Финляндии» и репрессированы.Умер Юрьё Вихманн 3 мая 1932 года в Хельсинки.