Родился 5 июля 1906 года в Гааге (Нидерланды), где его отец занимал должность Мастера винных погребов Её Величества («keldermeester» ) при дворе королевы матери Эммы. Его отец интересовался естественной историей, и выращивал бабочек.
Он любил ходить со своими детьми наблюдать за природой. Этот интерес превратился в страсть к биологии только в одном из его сыновей. После обычной школы Якоб с отличием закончил вторичную школу-гимназию (Hogere Burgerschool, HBS) в Гааге, затем обучался в Лейденском университете.1928 — закончил обучение в Лейденском университете и начал работать в Индонезии (тогда ещё голландской колонии: Голландская Ост-Индия) в Instituut voor Plantenziekten at Buitenzorg (= Institute for Plant Diseases and Pests, Богор, остров Ява).1933 — получил степень доктора наук в Лейденском университете.1942—1945 — пленение японскими оккупантами во время работы в Индонезии, тюремное заключение, выживание в суровых условиях и разлучение по разным лагерям с женой (она провела в лагерном заключении более 3 лет, после чего у них не было детей, а единственный ребёнок умер ещё до войны).1947—1951 — руководитель Institute for Plant Diseases and Pests (Богор, остров Ява, Индонезия).1955—1964 — работа куратором Hymenoptera в Rijksmuseum van Natuurlijke Historie, Лейден (Нидерланды)1962 — профессор («extraordinaris» ) по зоотаксономии в Университете Гронингена (Гронинген, Нидерланды).1964 — профессор («full» ) в Лейденском университете (Лейден).1963 — избрание членом Нидерландской королевской академии наук (Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen, Royal Dutch Academy of Sciences).Супруга Elizabeth M. (Bep) Bourguignon (умерла в 1986), часто помогала мужу в экспедициях.Умер 15 марта 1992 года в г. Пюттен (провинция Гелдерланд, Нидерланды).