Елена Ведута родилась 23 января 1950 года в Харькове. Отец — выдающийся экономист-кибернетик Н. И. Ведута.
В 1968 году поступила на экономический факультет МГУ, который окончила с отличием в 1973 году.
В 1973—1976 гг. училась в аспирантуре экономического факультета МГУ.
В 1980 году защитила кандидатскую диссертацию на тему «Увязка натуральных и ценностных показателей в межотраслевом балансе» .
В 1998 году защитила докторскую диссертацию на тему «Экономическая стратегия государства: трансформация приоритетов и механизмов их реализации» .Работала ведущим научным сотрудником в Институте проблем рынка РАН, в котором с 2003 г. заведовала лабораторией «Стратегические проблемы развития рыночной экономики» .
В 2003 году стала лауреатом конкурса на лучшее обеспечение учебного процесса Российской экономической академии им. Г. В. Плеханова.
С 2003 г. работала в МГУ заместителем заведующего кафедрой экономической политики философского факультета МГУ.
В 2011 г. перешла на факультет государственного управления МГУ.