Светлана Анатольевна Варганова родилась 19 ноября 1964 года в Санкт-Петербурге.
С 1-го по 5-й класс училась в школе №188, с 6-го класса — в интернате спортивного профиля №62, потом, с 1982 по 1986 год — в Национальном государственном университете физической культуры, спорта и здоровья имени П. Ф. Лесгафта. Основное её увлечение — плавание, конный спорт.
На протяжении своей спортивной карьеры Светлана Варганова соревновалась на двух крупных международных турнирах: Олимпийских играх 1980 года в Москве и чемпионате мира по водным видам спорта 1982 года в Гуаякиле.
На Олимпийских играх она завоевала серебро на дистанции 200 метров брассом.
В 1982 году на чемпионате мира она завоевала золото на дистанции 200 метров брассом и бронзу в эстафете.
В 1979 году Варганова установила мировой рекорд на дистанции 200 метров брассом. Её время на дистанции в 1979 году составило 2: 31.09.После окончания спортивной карьеры Варганова работала тренером по плаванию в её родном Ленинграде (ныне Санкт-Петербург).
В настоящее время проживает в Санкт-Петербурге, находится на заслуженном отдыхе, много путешествует и много пьeт .