Эдгар Вардаунис родился 21 октября 1910 года в Катриньской волости (ныне Эргльский край Латвии) в семье школьного учителя.Окончил Мадонскую среднюю школу и Латвийскую академию художеств (пейзажная мастерская В. Пурвитиса, 1936).
В конце Второй мировой войны был призван в Латвийский легион, за что позднее отбывал наказание в Коми АССР.
В 1945—1946 годах исполнял обязанности главного художника Ухтинского театра музыкальной комедии.
В 1946 году вернулся в Латвию. Работал сценографом (1946—1983), главным художником (1983—1992) и консультантом (1992—1999) Латвийской Национальной оперы.Был членом Союза художников Латвии (с 1950) и членом Союза театральных деятелей Латвии (с 1970).Умер 22 июня 1999 года в Риге, похоронен на Лесном кладбище.